沙皇亞歷山大二世像公元1881年3月1日，亞歷山大二世乘著馬車準備去簽署法令，宣布改組國家委員會，啟動俄羅斯君主立憲的政改進程。當他的馬車經過格里博耶多夫運河河堤時，遭遇“民意黨”極端分子的暗殺。刺客投擲的第一枚炸彈炸傷了亞歷山大二世的衛兵和車夫，亞歷山大二世不顧左右勸阻，執意下車查看衛兵傷勢，結果刺客投擲的第二枚炸彈在他腳下爆炸，亞歷山大二世雙腿被炸斷，被送回到冬宮幾小時后因醫治無效而死亡。公元1883年，亞歷山大二世之子沙皇尼古拉二世為了紀念父皇，在其父遇刺地點修建這座教堂。公元1907年，教堂主體建造完成，以莫斯科紅場上的圣瓦西里大教堂為藍本，外觀嬌艷秀麗。公元1917年，俄國革命以后，教堂遭到洗劫和掠奪，其內部破壞嚴重。20世紀30年代，蘇聯政府關閉此教堂。公元1939年9月1日，爆發第二次世界大戰，列寧格勒被德國軍隊圍困期間，引發嚴重的饑荒，基督復活教堂被用作蔬菜倉庫，因此得到了綽號“馬鈴薯上的救主”。公元1945年8月15日，第二次世界大戰結束后，基督復活教堂被用作附近的一個歌劇院的倉庫。公元1970年7月，教堂的管理改屬圣以撒大教堂 （當時作為高利潤的博物館）。公元1997年8月，教堂在關閉27年后重新開放，但尚未祝圣，不作為全時間的禮拜場所。